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Les boîtes à moustaches vous plaisent, mais R base vous lasse ? Tournez-vous vers {ggplot2} ! Si vous ne savez pas encore comment créer un graphique avec {ggplot2}, nous vous invitons à visiter notre page dédiée. Ensuite, c’est tout simple, il suffit d’utiliser le geom geom_boxplot ! À l’intérieur de votre aes, x sera votre variable de groupe, et y la variable numérique à visualiser. library(ggplot2) data(« DNase ») ggplot(DNase, aes(Run, density)) + geom_boxplot() Comment lire une boîte à moustache ? Le gros trait central indique la médiane. Les deux extrémités de la boîte les 1er et 3e quartiles — 50% des observations se trouvent donc dansRead More →

Les boxplots mettent parfois en évidence des individus qu’on peut qualifier d’atypiques ou outliers. Un fois mis en évidence graphiquement on peut les repérer et si nécessaire les enlever. #on crée un jeu de donnée b1<-c(0.1, 0.2,6,5,5,6,7,8,8,9,9,9,10,10,25)#on trace le boxplotboxplot(b1) #il y a 3 outliers #on met le boxplot dans un objet boxbox<-boxplot(b1)boxplot(b1)#box$out donne les outliers#on crée des nouvelles données sans les outliersb2<-b1[-which(b1%in%box$out)]#on vérifieboxplot(b2)Read More →

Vous voulez représenter vos données avec la boîte à moustache de Mr Tukey (boxplot)? Rien de plus facile avec R. #jeu de données fictif pour exemplea<-c(1,1,1,5,5,5,5,6,6,8,8,20,30)b<-c(0.5,4,5,6,6,6,6,6,7,7,7,7,8)#traçons les boxplots de base avec la fonction boxplotboxplot(a)boxplot(b)#on enlève les outliers, en mettant outline=FALSEboxplot(a,outline=FALSE)boxplot(b,outline=FALSE)#pour les mettre à l’horizontalboxplot(a,horizontal=TRUE)boxplot(b,horizontal=TRUE)#changer de couleurboxplot(a,border="blue")boxplot(b,border="purple")#nouveau jeu de données plus complexen<-c(1,1,1,5,5,5,5,6,6,8,8,20,30,0.5,4,5,6,6,6,6,6,7,7,7,7,8,3,5,8,8,8,8,8,9,9,9,9,11,12)m<-c(rep(‘A’,13),rep(‘B’,13),rep(‘C’,13))data<-data.frame(N=n,M=m)#on visualise le tableau ainsi créédatasummary(data)#On a 13 mesures pour chaque modalité (A,B,C)#comment avoir les boxplots pour chaque modalité?boxplot(data$N~data$M)#on enlève les outliers boxplot(data$N~data$M,outline=FALSE)#on change les couleurs avec l’argument borderboxplot(data$N~data$M,outline=FALSE,border=c("blue","purple","green"))#on change les noms avec names: A devient mesure1, B mesure2, C mesure3boxplot(data$N~data$M,outline=FALSE, names=c("mesure1","mesure2","mesure3"))#on ajoute les légendesboxplot(data$N~data$M,xlab="légende x",ylab="légende y",main="boxplot")#on colore les boîtes avec l’argument colboxplot(data$N~data$M,outline=FALSE,col=c("blue","purple","green")) #on changeRead More →

l’option mfrow va definir comment découper la fenetre graphique cela permet de mettre plusieurs grpahique dans la même fenêtre. par(mfrow=c(2,2)) boxplot(1:30) boxplot(10:30) boxplot(5:10) boxplot(1:3)Read More →